各省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市國家稅務(wù)局、地方稅務(wù)局：

　　《國家稅務(wù)總局關(guān)于國家經(jīng)貿(mào)委管理的10個國家局所屬科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制后稅收征收管理問題的通知》（國稅發(fā)〔1999〕135號）、《國家稅務(wù)總局關(guān)于貫徹落實〈中共中央國務(wù)院關(guān)于加強技術(shù)創(chuàng)新，發(fā)展高科技，實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的決定〉有關(guān)所得稅問題的通知》（國稅發(fā)〔2000〕24號），以及我局和科技部等六部門《關(guān)于印發(fā)建設(shè)部等11個部門（單位）所屬134個科研機構(gòu)轉(zhuǎn)制方案的通知》（國科發(fā)政字〔2000〕300號）下發(fā)后，各地在執(zhí)行過程中提出了一些問題。為了更好地貫徹落實中共中央、國務(wù)院有關(guān)文件精神，加強企業(yè)所得稅征收管理,經(jīng)研究，現(xiàn)就有關(guān)問題補充通知如下：

　　一、國科發(fā)政字〔2000〕300號文件所列134家轉(zhuǎn)制科研機構(gòu)，從2001年起至2005年底止，5年內(nèi)免征企業(yè)所得稅。

　　二、科研機構(gòu)聯(lián)合其他企業(yè)組建有限責(zé)任公司或股份有限公司，科研機構(gòu)在轉(zhuǎn)制企業(yè)中的股權(quán)比例達到50%的，按政策規(guī)定期限免征企業(yè)所得稅。

　　三、科研機構(gòu)與工程勘察設(shè)計單位聯(lián)合其他企業(yè)組建有限責(zé)任公司或股份有限公司，其中科研機構(gòu)在轉(zhuǎn)制企業(yè)中的股權(quán)比例達到50%的，按本通知第二條規(guī)定免征所得稅；工程勘察設(shè)計單位在轉(zhuǎn)制企業(yè)中的股權(quán)比例達到50%或者科研機構(gòu)與工程勘察設(shè)計單位在新組建企業(yè)中股權(quán)均達不到50%，但兩者股權(quán)合計達到50%的，按工程勘察設(shè)計單位轉(zhuǎn)制政策減半征收所得稅。

　　四、科研機構(gòu)在轉(zhuǎn)制企業(yè)中無形資產(chǎn)的價值所占股權(quán)比例低于20%的，據(jù)實計算控股比例；無形資產(chǎn)股權(quán)比例超過20%的，其超過部分不作為計算減免稅的股權(quán)。

　　五、鑒于轉(zhuǎn)制科研機構(gòu)優(yōu)惠政策的起訖時間不同，國稅發(fā)〔1999〕135號附件所列242家科研機構(gòu)以及其他科研機構(gòu)優(yōu)惠政策到期以后，應(yīng)重新計算減免稅政策未到期的轉(zhuǎn)制科研機構(gòu)及工程勘察設(shè)計單位在轉(zhuǎn)制企業(yè)中的股權(quán)比例，并按本通知第三條規(guī)定的精神確定是否享受減免所得稅政策。

　　六、根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)<企業(yè)所得稅減免稅管理辦法>的通知》（國稅發(fā)〔1997〕99號）規(guī)定，轉(zhuǎn)制企業(yè)減免稅實行一次審批的辦法，但在減免稅期間，主管稅務(wù)機關(guān)要對轉(zhuǎn)制企業(yè)享受優(yōu)惠政策的股權(quán)比例進行年檢核實，達不到規(guī)定比例的，應(yīng)取消其減免稅資格。